1. ส่วนการพยาบาล
2. ส่วนปกครองผู้ต้องขัง
3. ส่วนบริหารทั่วไป
4. ส่วนสวัสดิการผู้ต้องขัง
5. ส่วนทัณฑปฏิบัติ
6. องค์กรแพทย์
7. กลุ่มงานทันตกรรม
8. กลุ่มงานยุทธศาสตร์และแผน (มูลนิธิโรงพยาบาล)
9. กลุ่มงานเทคนิคบริการทางการแพทย์และเทคโนโลยีสารสนเทศ